By-, Land- og Kirkeministeriets hovedopgaver er fastlagt ved kgl. resolution om udnævnelse af ministre og fordeling af ministerområder, og ministeriets kerneopgaver er nærmere beskrevet i finansloven.

By-, Land- og Kirkeministeriets mission og vision er formuleret lyset af ministeriets hovedopgaver. Med henblik på at sikre en sammenhængende styring af By-, Land- og Kirkeministeriets arbejde fastlægger ministeriet desuden med jævne mellemrum et antal strategiske målsætninger med flerårigt perspektiv.

Departementet og Plan- og Landdistriktsstyrelsen udarbejder adskilte regnskaber (årsrapporter). De finansielle regnskaber indeholder regnskabsmæssige forklaringer for institutionernes ansvarsområde.